Moleküler biyoloji tekniklerinin analiz temellerini öğrenmek, bu teknikleri laboratuvar ortamında asistan eşliğinde uygulamak, deney sonuçlarının yorumlamasını yapabilmek, elde edilen sonuçlara göre deneysel prosedürün optimizasyonunu gerçekleştirmek
Ön Koşullar
Yok
Eş Koşullar
Yok
Özel Koşullar
Yok
Öğretim Üyeleri
Dr. Öğr. Üyesi Pelin Özfiliz Kılbaş, Dr. Öğr. Üyesi Özge Rencüzoğulları, Dr. Öğr. Üyesi Burcu Ayhan Şahin
Asistanlar
Arş. Gör. Enes Bal
Ders Gün,Saat ve Yeri
Grup1: Salı 09:00-13:00, Çarşamba 11:00-13:00, MBG Lab I
Grup2: Salı 13:00-17:00, Çarşamba 09:00-11:00, MBG Lab I
- Anlatım
- Tartışma
- Demonstasyon
- Laboratuvar uygulaması
- Laboratuvar raporu hazırlama
- Ödevler
- Bağımsız çalışma
Temel Kaynaklar
1. Editörler Güler Temizkan ve Nazlı Arda, Moleküler Biyolojide Kullanılan Yöntemler, Nobel Tıp Kitapevi, İstanbul, 2007 (ISBN: 9789754205831)
2. Editörler Atilla Özalpan ve Narçin P. Ünsal, Genomik Uygulamalar, T.C. İstanbul Kültür Üniversitesi Yayınları, İstambul, 2008
3. Dale, von Schantz, From Genes to Genomes: Concepts and Applicaitons of DNA Technology, 2nd Edition, John Wiley & Sons, Ltd, USA, 2007 (ISBN: 9780470017340)
Diğer Kaynaklar
Haftalık Ders Programı
Hafta
Dersin İçeriği
Öğretim Yöntem ve Teknikleri
1. Hafta
Moleküler biyoloji laboratuvarında güvenlik;
Laboratuvarın ve laboratuvarda kullanılacak olan ekipmanların tanıtımı;
Mikropipet kullanımı, Laboratuvar hesaplamaları;
pH ayarlamaları;
Kullanılacak olan solüsyon ve tamponların hazırlanması
Sözlü anlatım;
Laboratuvar
2. Hafta
Bitkilerden genomik DNA izolasyonu, Spektrofotometrik yöntemler;Spektrofotometri ile izole edilen genomik DNA konsantrasyonlarının hesaplanması
Sözlü anlatım;
Laboratuvar
3. Hafta
Memeli hücrelerinden genomik DNA izolasyonu, Spektrofotometrik yöntemler;Spektrofotometri ile izole edilen genomik DNA konsantrasyonlarının hesaplanması
Sözlü anlatım;
Laboratuvar
4. Hafta
Bakterilerden plazmit DNA izolasyonu, Spektrofotometrik yöntemler;
Sözlü anlatım;
Laboratuvar
5. Hafta
Agaroz Jel elektroforezi: Bitki, memeli, kandan izole edilen genomik DNA ile bakteriden izole edilen plazmitlerin farklı konsantrasyonlardaki agaroz jelde yürütülmesi
Spektrofotometri ile izole edilen genomik DNA konsantrasyonlarının hesaplanması
Sözlü anlatım;
Laboratuvar
6. Hafta
PCR çalışma prensibi, PCR optimizasyonu
Sözlü anlatım;
Laboratuvar
7. Hafta
PCR Tipleri; Jel ekstraksiyonu (PCR ürünlerinin jelden geri alınması saflaştırılması ve agaroz jelde analiz edilmesi
Sözlü anlatım;
8. Hafta
Ara sınav
Sözlü anlatım;
Laboratuvar;
Ödev;
Rapor
9. Hafta
Restriksiyon Enzimleri (RE), RFLP yöntemi, PCR ürünlerinin restriksiyon enzimi ile kesilmesi ve kesim ürünlerinin poliakrilamid jel elektroforez ile gösterilmesi
Sözlü anlatım;
Laboratuvar;
Rapor
10. Hafta
Polimorfizm tipleri, Farklı RE ile gen bölgelerinin kesimi çalışmaları ve SNP analiz ile allel belirleme
Sözlü anlatım;
Laboratuvar
11. Hafta
Blotlama tipleri: Southern blotlama, Kriminal Analiz ve babalık testleri
Sözlü anlatım;
Laboratuvar;
Rapor
12. Hafta
Moleküler Klonlama: Restriksiyon Enzim Kesimi ve Ligasyon
Sözlü anlatım;
Laboratuvar;
Rapor
13. Hafta
Moleküler Klonlama: Transformasyon
Sözlü anlatım;
Laboratuvar;
Ödev;
Rapor
14. Hafta
Moleküler Klonlama: Koloni Seçimi ve Sonuçların Değerlendirilmesi
Sözlü anlatım
15. Hafta
Final haftası
16. Hafta
Final haftası
17. Hafta
Final haftası
Değerlendirme Ölçütleri
Ölçüt Tipleri
Adet
Yüzdesi(%)
Ara sınav(lar)
1
25
Kısa sınav(lar)
2
20
Ödevler / Dönem Ödevi / Sunum
1
10
Laboratuvar raporu
1
10
Final
1
35
ÖÇ-1
Moleküler biyolojide kullanılan analiz yöntemlerinin işleyiş temellerini anlayabilme.
ÖÇ-2
Laboratuvar uygulamalarını için gereken hesapları yapabilme.
ÖÇ-3
Laboratuvar uygulaması ile elde edilen sonuçları ilgili analiz yönteminin temellerine dayanarak yorumlayabilme ve sonuçların iyileştirilmesi için gereken optimizasyon çalışmalarını yapabilme.
ÖÇ-4
Makromoleküllerin saflaştırılması, jel elektroforezi ve spektrofotometrik analiz yöntemlerini kendi başına uygulayabilecek beceriyi kazanma.
ÖÇ-5
Makromoleküllerin modifikasyonu için kullanılan PZR ve restriksiyon enzim kesimi gibi yöntemleri laboratuvarda kendi başına uygulayabilecek duruma gelme.
ÖÇ-6
Laboratuvar uygulamaları ile elde edilen sonuçları anlaşılır bir rapor halinde hazırlayıp sunabilme.
ÖÇ-7
Herhangi bir moleküler biyoloji problemi için gereken deneysel uygulamayı seçebilme, aşamalarını dizayn edebilme, uygulayabilme ve elde edilen sonuçları yorumlayabilme.
Program Çıktıları
PÇ-1
Matematik, fizik, kimya ve biyoloji gibi temel bilimlerden elde edilen verileri moleküler biyoloji ve genetiğin kapsadığı tüm alanlarla ilgili problemlere uygulayabilme.
PÇ-2
Moleküler biyoloji ve genetik ile ilgili tüm problemleri tanımlama, modelleme ve çözüm yolları üretme becerisi.
PÇ-3
Tanımlanan problem doğrultusunda analitik yöntemlerle süreci başlatabilme, ilerletebilme ve sonuçlandırma yetisi.
PÇ-4
Moleküler biyoloji ve genetik bölümünün başlıca çalışma alanı olan canlılar hakkında var olan tüm bilgileri genel anlamda kavrama yetisi.
PÇ-5
Bilimsel gelişmelere araştırma ve geliştirme yetileri ile katkılarda bulunma.
PÇ-6
Verileri çözümleme, deney yapma ve tasarlama, sonuçları yorumlama becerisi.
PÇ-7
Moleküler biyoloji ve genetik alanındaki güncel teknikleri ve hesaplama yöntemlerini kullanabilme.
PÇ-8
Ulusal veya uluslar arası toplumsal sorunlara çözüm odaklı, disiplin içi ve disiplinler arası takım çalışmasını uyumlu bir şekilde yapabilme ve en az bir yabancı dili mesleği ile ilgili kullanabilme yetisi
PÇ-9
Bağımsız davranma, inisiyatif kullanma ve yaratıcılık becerisi.
PÇ-10
Bireysel çalışma becerisi ve bağımsız karar verebilme yetisine sahip olarak fikirlerini sözlü ve yazılı, açık ve öz bir şekilde ifade ederek iletişim kurabilme.
PÇ-11
Mesleki ve etik sorumluluk bilincine sahip olabilme.
PÇ-12
Kalite konularında bilinç sahibi olabilme.
PÇ-13
Hayat boyu öğrenmenin önemini benimseyerek, alanı ve ilgili alanlara ilişkin güncel gelişmeleri takip ederek kendini geliştirebilme.
