Moleküler biyoloji tekniklerinin analiz temellerini öğrenmek, bu teknikleri laboratuvar koşullarında uygulayabilmek, uygulama sonuçlarının değerlendirilmesini gerçekleştirebilmek, yazılı olarak ifade edip tartışabilmek ve laboratuvar uygulamasının optimizasyonunu gerçekleştirebilmek
Ön Koşullar
-
Eş Koşullar
-
Özel Koşullar
-
Öğretim Üyeleri
Dr. Öğr. Üyesi Özge Rencüzoğulları, Dr. Öğr. Üyesi Burcu Ayhan Şahin, Dr. Öğr. Üyesi Pelin Özfiliz Kılbaş
Asistanlar
Arş. Gör. Pelin Özfiliz, Arş. Gör. Dr. Burcu Ayhan Şahin, Arş. Gör. Tamer Gümüş
Ders Gün,Saat ve Yeri
Henüz belli değil
Görüşme Saatleri ve Yeri
Her gün, MOBIGEN, Ataköy yerleşkesi
Öğretim Yöntem ve Teknikleri
- Öğretmen merkezli bilgisayar sunumu
- Anlatım
- Tartışma
- Laboratuvar uygulaması
- Laboratuvar raporu hazırlama
- Ödevler
- Öğrenci araştırma sunumları
Temel Kaynaklar
1. Editörler Güler Temizkan ve Nazlı Arda, Moleküler Biyolojide Kullanılan Yöntemler, Nobel Tıp Kitapevi, İstanbul, 2007 (ISBN: 9789754205831)
2. Editörler Atilla Özalpan ve Narçin P. Ünsal, Genomik Uygulamalar, T.C. İstanbul Kültür Üniversitesi Yayınları, İstambul, 2008
3. Dale, von Schantz, From Genes to Genomes: Concepts and Applicaitons of DNA Technology, 2nd Edition, John Wiley & Sons, Ltd, USA, 2007 (ISBN: 9780470017340)
4. Joe Sambrook, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Third Edition, (January 15, 2001
Diğer Kaynaklar
www.sciencedirect.com
www.ncbi.nlm.nih.gov
Haftalık Ders Programı
Hafta
Dersin İçeriği
Öğretim Yöntem ve Teknikleri
1. Hafta
Organik moleküllerle ilgiligenel bilgi: RNA ve protein çalışmalarında genel kullanım için hazırlanması gereken stok solüsyonlar
Sözlü anlatım;
Laboratuvar
2. Hafta
Memeli hücrelerinden Trizol kullanarak RNA izolasyonu ve izole edilen RNA'ların spektral analizi ve Agaroz Jel Elektroforezinde gösterilmesi
Sözlü anlatım;
Laboratuvar
3. Hafta
Bitkilerden Trizol kullanarak RNA izolasyonu ve izole edilen RNA'ların spektral analizi ve Agaroz Jel Elektroforezinde gösterilmesi
Sözlü anlatım;
Laboratuvar
4. Hafta
İzole edilen RNA'ların cDNA çevrilmesi, cDNA kalıp olarak kullanılarak RT-PCR yapılması ve jelde görüntülenmesi
Sözlü anlatım;
Laboratuvar;
Rapor
5. Hafta
İzole edilen RNA'ların cDNA çevrilmesi, cDNA kalıp olarak kullanılarak RT-PCR yapılması ve jelde görüntülenmesi
Sözlü anlatım;
Laboratuvar
6. Hafta
Memeli örneklerinden elde edilen qRT-PCR ile gösterilmesi
Sözlü anlatım;
Laboratuvar
7. Hafta
Bitki örneklerinden elde edilen qRT-PCR ile gösterilmesi
Sözlü anlatım;
Rapor
8. Hafta
Ara Sınav I
Ara Sınav I
9. Hafta
Bitkilerden Protein İzolasyonu, Bradford Yöntemi, Jel Görüntüleme
Sözlü anlatım;
Laboratuvar;
Rapor
10. Hafta
Memeli Hücrelerinden Protein İzolasyonu, Bradford Yöntemi, SDS-PAGE
Sözlü anlatım;
Laboratuvar
11. Hafta
Immunoblotlama, Görüntüleme, strip atma, trouble shooting, IP
Sözlü anlatım;
Laboratuvar;
Rapor
12. Hafta
2D Jel Elektroforezi
Sözlü anlatım;
Laboratuvar
13. Hafta
HPLC
Sözlü anlatım;
Laboratuvar;
Rapor
14. Hafta
ELISA
Sözlü Anlatım,
Laboratuvar
15. Hafta
Final haftası
16. Hafta
Final haftası
17. Hafta
Final haftası
Değerlendirme Ölçütleri
Ölçüt Tipleri
Adet
Yüzdesi(%)
Ara sınav(lar)
1
20
Kısa sınav(lar)
2
20
Ödevler / Dönem Ödevi / Sunum
2
20
Derse Devam / Katılım
1
10
Final
1
30
ÖÇ-1
Moleküler biyolojide kullanılan genel yöntemlerin analiz yapma temellerini anlayabilme.
ÖÇ-2
Laboratuvar uygulamaları için gereken hesaplamaların tamamını gerçekleştirebilme.
ÖÇ-3
Laboratuvar uygulaması ile elde edilen sonuçların ilgili analiz yöntemini temel alarak yorumlayabilme ve bu sonuçları temel alarak uygulamanın optimizasyonunu yapabilme.
ÖÇ-4
RNA izolasyonu ve ilgili kantifikasyon ve görüntüleme yöntemlerini laboratuvarda kendi başına uygulayabilecek duruma gelebilme.
ÖÇ-5
Protein izolasyonu, jel görüntülemesi, kantifikasyonu ve Western blotlama gibi ileri analiz yöntemlerini laboratuvarda kendi başına uygulayabilecek duruma gelebilme.
ÖÇ-6
Laboratuvar uygulamalarında elde edilen sonuçları anlaşılır bir rapor halinde hazırlayıp sunabilme.
ÖÇ-7
Moleküler biyolojide karşılaşılan problemler için gerekli deneysel uygulamayı seçebilme, uygulayabilme ve yorumlayabilme.
ÖÇ-8
Güncel bilimsel araştırma yayınlarını amaca ulaşmak için yapılan deneysel planlama, elde edilen sonuçların yorumlanması, sonuçlardan yola çıkarak ileri deneysel uygulamaların belirlenmesi gibi yaklaşımlarla analiz edebilme, kavrayabilme ve araştırma sonuçlarını bilgisayar ortamında hazırlayarak sunum yapabilme.
Program Çıktıları
PÇ-1
Matematik, fizik, kimya ve biyoloji gibi temel bilimlerden elde edilen verileri moleküler biyoloji ve genetiğin kapsadığı tüm alanlarla ilgili problemlere uygulayabilme.
PÇ-2
Moleküler biyoloji ve genetik ile ilgili tüm problemleri tanımlama, modelleme ve çözüm yolları üretme becerisi.
PÇ-3
Tanımlanan problem doğrultusunda analitik yöntemlerle süreci başlatabilme, ilerletebilme ve sonuçlandırma yetisi.
PÇ-4
Moleküler biyoloji ve genetik bölümünün başlıca çalışma alanı olan canlılar hakkında var olan tüm bilgileri genel anlamda kavrama yetisi.
PÇ-5
Bilimsel gelişmelere araştırma ve geliştirme yetileri ile katkılarda bulunma.
PÇ-6
Verileri çözümleme, deney yapma ve tasarlama, sonuçları yorumlama becerisi.
PÇ-7
Moleküler biyoloji ve genetik alanındaki güncel teknikleri ve hesaplama yöntemlerini kullanabilme.
PÇ-8
Ulusal veya uluslar arası toplumsal sorunlara çözüm odaklı, disiplin içi ve disiplinler arası takım çalışmasını uyumlu bir şekilde yapabilme ve en az bir yabancı dili mesleği ile ilgili kullanabilme yetisi
PÇ-9
Bağımsız davranma, inisiyatif kullanma ve yaratıcılık becerisi.
PÇ-10
Bireysel çalışma becerisi ve bağımsız karar verebilme yetisine sahip olarak fikirlerini sözlü ve yazılı, açık ve öz bir şekilde ifade ederek iletişim kurabilme.
PÇ-11
Mesleki ve etik sorumluluk bilincine sahip olabilme.
PÇ-12
Kalite konularında bilinç sahibi olabilme.
PÇ-13
Hayat boyu öğrenmenin önemini benimseyerek, alanı ve ilgili alanlara ilişkin güncel gelişmeleri takip ederek kendini geliştirebilme.
