Dersin amacı; hastalık (karsinogenez, metabolik hastalıklar, nörolojik hasarlar vb. gibi) modellerinde biyomarkırlar, biyomarkır tanımlanmasında uygulanan yöntemler, biyomarkır tespit edilmesinde kullanılan proteomik yöntemler; 2D gel elektroforezi, SILAC, kütle spektroskopisi, Protein mikroarray kullanımları ve elde edilen verilerin değerlendirilmesinde biyoinformatik yöntemlerin öğretilmesi
Ön Koşullar
-
Eş Koşullar
-
Özel Koşullar
-
Öğretim Üyeleri
Dr. Öğr. Üyesi Pelin Özfiliz Kılbaş
Asistanlar
Ders Gün,Saat ve Yeri
-
Görüşme Saatleri ve Yeri
-
Öğretim Yöntem ve Teknikleri
-Sözlü sunum
- Demonstrasyon
-Makale Okuma
Temel Kaynaklar
-Victor R. Preedy and Vinood B. Patel, "General Methods in Biomarker Research and their Applications (Biomarkers in Disease: Methods, Discoveries and...Aug 14, 2015
- Victor R. Preedy and Vinood B. Patel, "Biomarkers in Cancer (Biomarkers in Disease: Methods, Discoveries and Applications)Jun 23, 2015"
Diğer Kaynaklar
-
Haftalık Ders Programı
Hafta
Dersin İçeriği
Öğretim Yöntem ve Teknikleri
1. Hafta
Biyomarkır tanımı
Sözlü sunum, demonstrasyon
2. Hafta
Hastalıklarda biyomarkır olabilme kriterleri
Sözlü sunum, demonstrasyon ve makale okuma
3. Hafta
Kanser ile ilişkili biyomarkılar
Sözlü sunum, demonstrasyon ve makale okuma
4. Hafta
Metabolik hastalıklar ile ilişkili biyomarkırlar
Sözlü sunum, demonstrasyon ve makale okuma
5. Hafta
Nörolojik hastalıklar ile ilişkili biyomarkırlar
Sözlü sunum, demonstrasyon ve makale okuma
6. Hafta
Biyomarkı tanımlamasında uygulanan yöntemler
Sözlü sunum, demonstrasyon ve makale okuma
7. Hafta
Vize
-
8. Hafta
2D-Elektroforezi ile biyomarkır belirleme
Sözlü sunum, demonstrasyon ve makale okuma
9. Hafta
SILAC yöntemi ile biyomarkır belirleme
Sözlü sunum, demonstrasyon ve makale okuma
10. Hafta
Protein array ile biyomarkır belirleme
Sözlü sunum, demonstrasyon ve makale okuma
11. Hafta
Antikor array ile biyomarkır belirleme
Sözlü sunum, demonstrasyon ve makale okuma
12. Hafta
Biyoinformatik yöntemler ile veri analizi
Sözlü sunum, demonstrasyon ve makale okuma
13. Hafta
Biyoinformatik yöntemler ile veri analizi
14. Hafta
Final
-
15. Hafta
16. Hafta
17. Hafta
Değerlendirme Ölçütleri
Ölçüt Tipleri
Adet
Yüzdesi(%)
Ara sınav(lar)
1
40
Final
1
60
ÖÇ-1
Karsinogenez, metabolik hastalıklar, nörolojik hasarlar gibi hastalık modellerinde biyomarkır olma kriterleri hakkında bilgi sahibi olmak
ÖÇ-2
Biyomarkır tanımlanmasında uygulanan yöntemlerin çalışma prensiplerini kavrayabilmek
ÖÇ-3
Biyobelirteç belirleme tekniklerinde güncel proteomik yöntemlerin uygulama stratejilerini kavrayabilmek
ÖÇ-4
Biyoinformatik analizler ile moleküler tanı yöntemlerinden elde edilen verileri kavrayabilmek ve değerlendirebilmek
Program Çıktıları
PÇ-1
Lisans ve yüksek lisans yeterliliklerine dayalı olarak alanındaki güncel ve ileri
düzeydeki bilgileri özgün düşünce ve/veya araştırma ile uzmanlık düzeyinde
geliştirmek, derinleştirmek ve bilime yenilik getirecek özgün tanımlara ulaşmak.
PÇ-2
Alanıyla ilgili çeşitli disiplinler arasındaki etkileşimi kavramak; yeni ve karmaşık
fikirleri analiz, sentez ve değerlendirmede uzmanlık gerektiren bilgileri kullanarak
özgün sonuçlara ulaşmak.
PÇ-3
Alanındaki yeni bilgilere sistematik bir biçimde yaklaşabilmek.
PÇ-4
Bilime yenilik getiren bir bilimsel yöntem geliştirebilmek ya da bilinen bir yöntemi
farklı bir alana uygulayabilmek.
PÇ-5
Alanı ile ilgili yaygın etkisi olan bilimsel çıktıları elde edebilme ve değerlendirme
yetisi kazanan birey yetiştirmek.
PÇ-6
Uzmanlık alanında üretmiş olduğu bilimsel çıktıları yorumlayabilmek ve işlevsel
etkileşim stratejileri ile sunabilmek.
PÇ-7
Bilimsel sorun çözmede stratejik karar verebilmek ve çözümü üretebilmek.
PÇ-8
Alanında ve ilgili sektörde karşılaşılan toplumsal, bilimsel ve etik konularda çözüm
üretebilmek ve bu değerlerin gelişimini destekleyebilmek.
PÇ-9
En az bir yabancı dilde, ileri düzeyde, yazılı, sözlü ve görsel iletişim kurabilmek ve tartışabilmek ("European Language Portfolio Global Scale", Level C1).
PÇ-10
Özgün ve disiplinlerarası sorunların çözümlenmesini gerektiren ortamlarda liderlik
yapabilmek.
PÇ-11
Alanıyla ilgili araştırma yöntemlerinde üst düzeyde beceri kazanabilmek.
PÇ-12
Özgün bir konuyu araştırabilmek, tasarlayabilmek, kavrayabilmek ve uygulayabilmek.